鸡白痢沙门氏菌分离株invA基因的克隆与序列分析

摘要

为了克隆新疆分离株invA基因,并更进-步探讨该基因的结构与功能.本试验以鸡白痢沙门氏菌新疆分离株为模板,通过PCR方法对invA基因进行克隆,并对其进行生物信息学分析.结果表明,PCR方法成功扩增出invA基因大小为1251bp的特异性目的条带,共编码417个氨基酸;该基因与鸡白痢沙门氏菌标准株的invA基因的核苷酸序列的同源性为99.8%,与其他物种invA基因的核苷酸序列的同源性为24.9%-54.0%;鸡白痢沙门氏菌新疆株invA基因所推导的氨基酸序列与参考株的同源性为99.77,与其他物种的invA基因所编码的氨基酸序列的同源性为22.0%-70.7%;该分离株invA蛋白预测的二级结构和三级结构以a-螺旋和折叠为主,为非分泌蛋白;从遗传进化树上可知,该鸡白痢沙门氏菌分离株invA基因的核苷酸序列与标准株在同一个进化分支上,与其他物种的invA基因的亲缘关系较远.该研究为新疆鸡白痢沙门氏菌的流行规律、遗传变异特征以及诊断试纸条的研究提供了依据.