刺五加鲨烯合酶基因2cDNA的克隆与蛋白结构分析

摘要

采用RT-PCR和RACE法克隆了刺五加鲨烯合酶基因2(squalene synthase gene 2,SS2) cDNA的全长序列(GenBank登录号:JN714465).该序列全长1 463 bp,其中5’端非翻译区长10 bp,3’端非翻译区长208 bp,开放阅读框长1 245 bp,编码414个氨基酸.该蛋白具有1个Trans IPPS HH保守区域、2个鲨烯合酶和八氢番茄红素合成酶特异性识别区域及2个跨膜区.氨基酸序列比对结果表明,该蛋白与五加科其它植物SS的一致性均大于90％,与刺五加SS1的一致性为91.79％.