2株H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因组序列分析

摘要

目的 了解2株H9N2亚型禽流感病毒(AIV)毒株A/环境/宁夏/27740/2018(简称NX40)和A/环境/宁夏/27748/2018(简称NX48)血凝素(HA)基因变异情况.方法 对全区禽流感监测点采集的环境标本采用Real time RT-PCR方法进行核酸检测,对核酸检测阳性标本进行病毒分离.对H9N2亚型分离株提取RNA,通过RT-PCR反应扩增HA基因片段并测序,测定的序列利用生物信息软件进行分析.结果 2株毒株的HA基因含有8个潜在的糖基化位点,226位的氨基酸残基均为Gln,裂解位点为RSSRGLF,受体结合位点为YWTNTLY,HA基因核苷酸同源性为88.2％～ 96.6％.结论 2株分离株对人的感染力没有增强,为典型的低致病力禽流感病毒;与参考株比较发生了一定程度的变异,2株毒株亲缘关系较近,与近年国内其他地区分离株同源性较高.