变性梯度凝胶电泳检测鲍曼不动杆菌中SHV基因单核苷酸多态性

摘要

目的 建立变性梯度凝胶电泳(DGGE)检测超广谱β内酰胺酶(ESBL)基因中单核苷酸多态性(SNP)的方法,并获得鲍曼不动杆菌中SHV基因SNP的资料.方法 采用DGGE并结合DNA序列测定,检测了24株SHV基因阳性的鲍曼不动杆菌SHV基因SNP.结果 对这些菌株SHV基因的PCR产物直接进行DGGE电泳时,24例标本均呈现出单一条带,但条带的位置明显不同,可分为A、B两组;对两组标本分别用含GC后央的引物进行SHV基因PCR扩增后再行DGGE,结果显示各产物均为单一条带,而且每组条带均处于同一位置.测序结果表明两组产物分别为SHV-1b-Like、SHV-18-Like.结论 目前该地区鲍曼不动杆菌中SHV基因存在两种型别.通过DGGE,不仅能简便、迅速地获得某种基因的SNP资料,而且有利于高效和经济地筛选出新的核苷酸突变.