文冠果ABI3转录因子全长cDNA序列与生物信息学分析

摘要

文冠果是我国北方特有的优良木本食用油料树种.ABI3是种子发育过程中重要的转录调控因子.根据文冠果转录组数据获得ABI3基因序列(XsABI3),并对XsABI3基因的cDNA进行生物信息学分析.结果表明,XsABI3基因cDNA序列含有一个长度为1977 bp的完整ORF,可编码658个氨基酸.XsABI3转录因子中的氨基酸大部分表现亲水性,由200个α螺旋、39个延伸链、14个β-转角、405个无规则卷曲构成.通过5yzy.1.C同源建模法,得到1个三级结构模型,该模型从第576个氨基酸开始到第650个氨基酸结束.XsABI3氨基酸序列与其他11种植物的ABI3氨基酸序列进行同源性比较表明,文冠果ABI3与甜橙的ABI3同源性最高(67％).该研究结果将为研究文冠果种子生长发育及其油脂合成积累的调控机制提供新的理论基础,也为文冠果高油种质的分子育种工作提供重要参考.