HMMR基因在结肠癌中的表达及其对患者预后的影响

摘要

目的采用生物学方法探究HMMR基因在结肠癌中的表达,分析其与结肠癌患者预后的关系。方法利用R语言相关软件包对NCBI数据库中GSE140973样本进行筛选和分析获取差异表达基因,通过GO分析和KEGG分析进行功能和途径富集分析、并对其进行PPI网络构建,通过Cytoscape软件对PPI网络进行可视化以及获取Hub基因,通过GEPIA平台进行差异表达分析和生存分析,最终筛选出目标基因。结果在GSE140973中共发现807个DEGs;GO分析和KEGG分析显示,DEGs主要富集在有丝分裂细胞周期、染色体分离、糖酵解/糖异生、细胞周期等过程中,进一步分析获得HMMR、SHCBP1、ERCC6L、ZWINT、FAM83D、CDCA2、SPC25、SKA1、KIAA0101、MND1共10个Hub基因;生存分析和差异表达分析显示,HMMR基因在结肠癌组织和正常组织中的表达不同,其表达与患者预后有关。结论在结直肠癌组织中HMMR基因呈高表达,且HMMR基因高表达与结肠癌患者预后相关。