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基于HMMR在肺腺癌组织中表达水平及其对LUAD患者预后影响的生物信息学分析

         

摘要

目的:探讨透明质酸介导的细胞游走受体(HMMR)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达及其对LUAD患者预后的影响,阐明HMMR在LUAD发生发展中的作用.方法:通过基因表达汇编(GEO)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和人类蛋白图谱(HPA)数据库评估LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平.采用GEPIA2数据库分析HMMR表达对LUAD患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)的影响,采用TCGA数据库分析HMMR mRNA表达与LUAD患者临床病理参数及预后的关系,采用GSEA富集分析探讨HMMR在LUAD组织中显著富集的通路,采用UALCAN数据库探讨HMMR mRNA表达与TP53基因突变的关系,采用STRING数据库预测HMMR与p53信号通路中蛋白的相互作用.结果:LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平明显高于正常组织和癌旁组织(P<0.01).HMMR mRNA表达水平较高的患者OS和DFS更短(P<0.01).LUAD组织中,HMMR mRNA表达与患者TNM分期、T分期和N分期有关联(P<0.01).单因素和多因素Cox分析,HMMR mRNA高表达的患者OS更短.GSEA富集分析,细胞周期、同源重组、p53信号通路、膀胱癌、胰腺癌、小细胞肺癌和泛素化介导的蛋白水解等通路显著富集在HMMR高表达显型.结论:LUAD组织中HMMR表达明显上调,高表达的HMMR mRNA是LUAD患者预后差的独立评价指标.

著录项

  • 来源
    《吉林大学学报(医学版)》 |2021年第6期|1502-1509|共8页
  • 作者单位

    锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学药学院 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室 辽宁 锦州 121000;

    辽宁省人类表型组学重点研究实验室 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室 辽宁 锦州 121000;

    锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室 辽宁 锦州 121000;

    辽宁省人类表型组学重点研究实验室 辽宁 锦州 121000;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 肺肿瘤;生物信息论;
  • 关键词

    肺腺癌; 透明质酸介导的运动受体; 数据库; 预后;

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