西藏小型猪SLA-DQA基因外显子2 的PCR-RFLP多态性分析

摘要

目的 分析西藏小型猪SLA-DQA基因第2外显子不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg 平衡态.方法 采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对西藏小型猪SLA-DQA 目的 基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的外显子2进行 PCR-RFLP分析.结果 结果 表明,经EcoRⅠ酶切后,以纯合子BB基因型居多,BB、 AB、AA基因型频率分布为0.4500、0.3167和0.2333,其中B 为优势等位基因(0.6083); 经AluⅠ酶切后,MN基因型频率(0.5000)分别高于MM型(0.3000)和 NN型(0.2000),其中M为优势等位基因(0.5500).经卡方适合性检验验证, EcoRⅠ酶切位点c2值未达到显著水平(P >0.05),而AluⅠ酶切位点c2值则具有显著差异( P<0.05).综合双酶切结果 ,共出现7种组合带型,其中 BBMM组合带型出现的频率最高(0.3000),暂没有发现AANN以及 BBNN两种组合带型.结论 西藏小型猪SLA-DQA基因在AluⅠ酶切位点上没有达到Hardy-Weinberg 平衡态,在该位点的遗传选择压力较EcoRⅠ位点大.