一种山黄麻丛枝病的分子检测与鉴定

摘要

以植原体通用引物P1/P7和R16F2n/R16R2对云南省峨山县发现的山黄麻丛枝病感病植株,总DNA进行巢式PCR扩增、克隆和测序,获得1246 bp原体16S rDNA序列.经iPhy-Classifier植原体在线分类鉴定工具分析,显示该植原体与翠菊黄化植原体(Candidatus Phytoplasma asteris)相关,与该组参考株系(M30790)的序列相似性为99.6％,属16S rI组成员,16S rDNA的F2nR2片段的RFLP模型与16Sr I-B亚组的参考模型(AP006628)最为相似,相似系数F为0.96,推测是一个16 S rI组新亚组.以MEGA软件和MUSCLE在线工具进行多序列比对和系统进化树构建,显示山黄麻丛枝植原体(SHMWB-ES)与16Sr I组成员聚为一支,在亚组构建中显示16Sr I组与16Sr I-B亚组的菌株BSP-Br1(EU423898)、16Sr I-X亚组的TLWBYN01(MN513329)、BG01(LT594117)及BG02(LT594118)菌株序列同源性都在99％以上,与前两者更高达为99.76％和99.84％.