云南番木瓜环斑病毒部分ci基因的克隆及序列分析

摘要

对云南昆明、楚雄、保山、德宏、临沧、玉溪、红河等地番木瓜、南瓜和罗汉果上获得的番木瓜环斑病毒（Papayaringspotvirus，PRSV）不同分离物进行了部分ci基因的克隆和序列分析，获得的部分ci基因长666nt，编码221个氨基酸。关于13个PRSV云南分离物部分ci基因核苷酸序列的同源性为80％。98％，氨基酸同源性为92％-100％。选取本文具有代表性的9个PRSV分离物与国内外12个PRSV分离物相比，核苷酸序列的同源性为79％-93％，氨基酸序列同源性为92％-99％。运用MEGA软件绘制的基于部分ci基因核苷酸序列的系统进化树表明，这些PRSV病毒可以分为两个大组，本文获得的9个云南分离物中的8个分离物与印度分离物（India—W—EU475877）聚为第1组，第Ⅱ组成员比较复杂，包括大部分的亚洲分离物及全部美洲分离物。