中国亚热带地区3种榧属植物叶绿体微卫星特征分析

摘要

为获取更多榧属(Torreya)植物叶绿体基因组数据并开发叶绿体通用微卫星引物,对长叶榧(T.jackii)和榧树(T.grandis)进行叶绿体全基因组测序,并与已公布的的巴山榧(T.fargesii)进行比较,同时应用生物信息学软件对三者的叶绿体微卫星分布特征和规律进行全面分析.结果表明,长叶榧、榧树和巴山榧叶绿体基因组均为环状双链DNA,总长度在136720～137075bp之间.3种榧属植物的叶绿体微卫星数量以榧树中最多,为42个,其次为长叶榧(36个),巴山榧中最少(34个).3种榧属植物叶绿体微卫星重复类型均以单碱基重复最多,其次为四碱基重复.3种榧属植物单碱基重复类型均以(A)n和(T)n为主,重复次数分别以10次和11次最多.该结果可为后续开发榧属植物叶绿体通用微卫星引物提供重要信息.