中国大陆基因2a/Ⅲ型丙型肝炎病毒部分基因的cDNA序列分析

摘要

目的分析来源于徐州的中国株２ａ／Ⅲ型丙型肝炎病毒（ＨＣ－ＸＺ）的部分核苷酸序列。方法以逆转录巢式聚合酶链反应获得位于７９１８位至８２９３位间的ｃＤＮＡ片段，聚合酶链反应直接序列分析技术测定核苷酸序列，计算机分析其特征。结果与日本株２ａ／Ⅲ型丙型肝炎病毒（ＨＣＪ６）及中国株１ｂ／Ⅱ型丙型肝炎病毒ＨＣＣ２相比，ＨＣＸＺ在核苷酸水平的同源性分别为８９．６０％与６８．００％，在氨基酸水平的同源性分别为９２．９２％与６９．０３％。ＨＣＸＺ与ＨＣＪ６在此区域的亲水性相仿。结论ＨＣＸＺ与ＨＣＪ６属于同一亚型，且亲缘性较高。