5-羟甲基胞嘧啶pKa值的理论研究

摘要

采用两种不同动力学循环方案,在B3LYP/6-311++G(d,p)+ZPE和B3 LYP/aug-cc-pVTZ//B3LYP/6-311++G(d,p)+ZPE水平上,同时考虑PCM和CPCM模型对5-羟甲基胞嘧啶(5-HMeCyt)中N3、N4、O2不同位点质子化的pKa值进行计算研究.结果表明:采用经验值法,5-HMeCyt中N3位置质子化的pKa值最大;采用质子交换法,以N3质子化的胞嘧啶为参考酸,发现CPCM模型计算结果对计算方法的依赖性较大.