富民枳种质资源的SSR遗传多样性研究

摘要

以野外已经灭绝的极小种群植物富民枳为对象,基于当前建立的种质资源收集圃开展群体遗传分析研究,探讨种质资源收集保存和野外回归的有效途径,为极小种群植物的拯救保护提供科学依据.利用毛细管电泳检测,从已发表的51个柑橘属SSR引物中,筛选出特异性高和多态性好的,对采集自10个种质资源收集地的170份富民枳样本进行遗传多样性分析,采用POPGENE、PIC_Calc、Populations、FigTree和Origin软件分别进行遗传参数估计、 引物多态性信息含量计算、 邻接树构建和聚类图的绘制.结果显示:SSR引物的多态性信息含量(PIC)平均为0.3378;Shannon信息指数(I)平均为0.6428;有效等位基因数(Ne)平均为1.7987;Nei's遗传多样性指数(Nei)平均为0.4300;平均期望杂合度(He)为0.4300;平均观测杂合度(Ho)为0.5687.聚类分析显示,170个富民枳样本共聚类了65个分支末梢,属于同一个分支末梢的被默认为同等的遗传关系,我们称这65个样本为"有效样本".综合评价结果表明:富民枳现存种质资源的遗传多样性水平较低,只有C2和C7在遗传水平上的保护是有效的,即有效样本量大于10,Shannon信息指数又达到该物种遗传多样性水平的90％以上.本研究结果为该物种有效的遗传管理奠定了理论基础.