基于EST-SSR标记的陕西茶树种质资源遗传多样性研究

摘要

[目的]明确陕西省茶树种质资源的遗传多样性,为茶树育种提供依据.[方法]以陕西地方和野生种质资源、陕西临近省份以及西南茶区共8个省份的118份茶树资源为材料,利用43对高质量EST-SSR引物,用PROSize 2.0软件统计扩增条带,用Powermarker V3.25分析软件计算主等位基因频率(MAF)、基因型、等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、Nei基因多样性指数(H)和多态信息含量(PIC),用MEGA 6软件进行UPGMA聚类分析,对陕西茶树资源的遗传多样性进行分析.[结果]从118份茶树材料中共检测到310个等位基因和832个基因型.主等位基因频率(MAF)、每个位点等位基因数(N.)、扩增基因型和多态信息含量(PIC)的平均值分别为0.3368,7.21个,19.35和0.7272.Nei基因多样性指数(H)在0.2323～0.9110,平均值为0.7600;观察到的杂合度(Ho)在0.1057～0.9918,平均值为0.8112.聚类分析结果将陕西省茶树种质资源分为3大类群,同一地区的陕西茶树资源多聚在一起;对不同地区茶树资源的聚类结果表明,陕西省茶树资源聚为一支,且与湖北的茶树资源关系较近.[结论]陕西省茶树资源具有丰富的遗传多样性和相对独立的遗传背景,且与湖北省茶树资源遗传关系较近.