精子相关抗原9 B细胞及T细胞表位富集区预测

摘要

目的：预测人精子相关抗原9（SPAG-9）的表位富集区。方法：以SPAG-9的全长序列为基础，利用生物信息学软件，采用Hopp＆Woods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案，并结合SPAG-9的二级结构与其柔性区域及跨膜区域对SPAG-9的优势B表位进行综合分析，进一步运用抗原指数分析预测SPAG-9的B细胞表位。同时，分别应用SYFPEITHI、NetCTL以及IEDB预测HLA-A2、HLA-A24限制的CTL表位。最后，综合B细胞表位和CTL表位，预测SPAG-9的表位富集区。结果：经综合分析，SPAG-9的B细胞优势表位可能存在于N端的197-201，236-243，249-253，291-299，306-312，324-327，332-337，348-352，488-494，539-542，546-550，565-573，699-702，802-807，869-873，875-880，882-887，1173-1178，1195-1200区段。其HLA-A2限制的CTL表位肽为19-27，49-57，50-58，56-64，343-351，381-389，413-421，447-455，521-529，551-559，665-673，733-741，837-845，926-934，950-958，964-972，998-1006，1016-1024，1094-1102，1140-1148，1150-1158区段，HLA-A24限制的CTL表位肽为31-39，137-145，517-525，943-951。综合B表位与CTL表位，SPAG-9的332-352与551-573区段，即SAENEEKSEVQAIIESTPELD、SIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPP肽段是SPAG-9的表位富集区。结论：利用生物信息学预测发现SPAG-9抗原的332-352与551-573为SPAG-9的表位富集区。