Illumina高通量测序技术检测医院内空气中微生物

摘要

目的:应用Illumina高通量测序技术对医院内空气环境进行检测,了解医院内不同科室空气中常见微生物的分布特点。方法:利用恒流负压收集器采集北京医院门诊、急诊、外科监护室、呼吸监护室4个科室的空气样本,提取微生物DNA样本,利用Illumina高通量测序技术分析不同科室空气环境中微生物的种类和相对含量。结果:高通量测序的方法可一次性检出上千种微生物,如真菌、细菌、病毒,其优势在于对真菌的鉴定。在外科监护室、呼吸监护室,致病性真菌占空气中真菌的比例较高,分别为60.37%、81.59%,而在门诊、急诊,该比例稍低,分别为53.25%、58.98%。在真菌菌属分类中,霉菌中的曲霉,酵母菌中的隐球菌和念珠菌所占比例较高。结论:高通量测序技术应用于医院环境监测,可提供更多机会性感染的病原菌信息,对改进医院环境监控的技术方法及提高医院感染的监控水平提供实验基础。