基于高通量测序技术的小麦病原微生物检测方法及其应用

摘要

本申请公开了一种基于高通量测序技术的小麦病原微生物检测方法及其应用。本申请的检测方法，包括1)提取待检小麦或小麦筛下物的基因组DNA；2)采用真菌ITS区通用引物对基因组DNA进行PCR扩增建库；3)高通量测序；4)将高通量测序结果根据97％以上相似性进行聚类分析，根据分类单元分析取待检小麦样品或小麦筛下物样品的病原微生物群落。本申请的检测方法，利用高通量测序技术，对小麦或小麦筛下物的基因组DNA进行测序，并通过生物信息学分析得到OTU，全面的分析出小麦携带病原真菌情况，为评估其有害性和风险性奠定了基础，特别适用于进出境检验检疫等部门，以突破或制定出相应的技术壁垒，保障小麦生产和贸易的安全。