绵羊骨骼肌转录组高通量测序从头组装和特征分析

摘要

本实验旨在对绵羊肌肉转录组进行组装分析,以丰富绵羊的基因组并为进一步对绵羊的相关基因的分子遗传学研究奠定基础.选取Illumina Hiseq 2000测序平台对杜泊羊和小尾寒羊的骨骼肌转录组文库进行了高通量测序,并对测序数据进行从头组装分析.结果表明:两个测序文库共得到103058824个长为2×90 bp的高质量的测序序列,经从头组装共产生了145524个unigenes.两个文库间有5718个unigenes差异表达,经GO注释分析后发现它们主要分布在细胞、细胞过程和结合条目中.将两个文库的unigenes进一步组装得到70348个平均长为863 bp的all-unigenes,其中35201个被注释到Nr数据库,12219个被注释到COG数据库,并与KEGG数据库中的258个功能通路中的蛋白质和氨基酸新陈代谢通路密切相关.