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4种笛鲷AFLP引物筛选及其遗传多样性分析

         

摘要

10.3969/j.issn.1009-5470.2012.04.015%  以湛江近海的勒氏笛鲷Lutjanus russellii、紫红笛鲷L. argentimaculatus、红鳍笛鲷L. erythropterus、千年笛鲷L. sebae为研究对象,采用EcoR /ⅠMselⅠ双酶切组合,对4种笛鲷进行扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism, AFLP)标记的开发和筛选,并对其进行遗传多样性分析.从50对引物中筛选适合4种笛鲷的AFLP引物,其中勒氏笛鲷筛选出24对,获得位点1431个,多态位点比例为22.85%;紫红笛鲷筛选出20对,获得位点1370个,多态位点比例为17.08%;红鳍笛鲷筛选出22对,获得位点1403个,多态位点比例为17.18%;千年笛鲷筛选出22对,获得位点1349个,多态位点比例为12.90%.Nei氏遗传距离法计算每种笛鲷30个个体之间的平均遗传距离,勒氏笛鲷为0.1035,紫红笛鲷为0.0719,红鳍笛鲷为0.0805,千年笛鲷为0.0572.选取2对引物对4种笛鲷群体间遗传多样性进行分析,获得总位点140个,多态位点104个.4种笛鲷种群间遗传距离分布在0.3773—0.6650,明显高于各笛鲷种群内遗传距离,其中紫红笛鲷和千年笛鲷的遗传距离最远,为0.6650,勒氏笛鲷和红鳍笛鲷的遗传距离最近,为0.3773.

著录项

  • 来源
    《热带海洋学报》 |2012年第4期|112-116|共5页
  • 作者单位

    广东海洋大学水产学院, 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室, 广东 湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院, 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室, 广东 湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院, 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室, 广东 湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院, 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室, 广东 湛江 524025;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 分子遗传学;鲈形目;
  • 关键词

    笛鲷; 扩增片段长度多态性; 遗传多样性; 系统发育分析;

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