芒根组织在不同非生物胁迫下最适内参基因的筛选

摘要

[目的]筛选不同非生物胁迫下芒根组织中稳定表达的内参基因,并为调控芒根组织中基因表达提供理论依据.[方法]以芒(Miscanthus sinensis)根组织为试验材料,通过实时荧光定量PCR技术检测12个候选内参基因在不同非生物胁迫环境(干旱、盐、镉、铬和砷)下的表达情况,并运用geNorm、BestKeeper、NormFinder和RefFinder软件分析它们在芒根组织中的稳定性.[结果]在不同的非生物环境胁迫条件下,最稳定的内参基因各不相同.12个内参基因表达稳定性由高到低排序为:Unigene26576,Unigene33024,Sb02g041180,eIF4A,ACTIN,GAPDH,Unigene33312,Sb09g019750,PP2A,SAMDC,18S rRNA,SAMS.其中在干旱胁迫条件下,Sb02g041180和ACTIN基因最稳定;在盐胁迫和砷胁迫处理下最稳定的内参基因分别是Sb09g019750和Unigene26576、Sb09g019750和PP2A;镉和铬胁迫下最稳定的内参基因分别为Unigene26576和PP2A、Sb09g019750和Unigene33312.[结论]Unigene26576和Unigene33024最适合作为研究芒根组织非生物胁迫的内参基因,而18S rRNA和SAMS最不适合作为内参基因.鉴定了候选基因在芒根组织中的稳定性,对进一步研究芒非生物胁迫下基因表达奠定了基础.