肾透明细胞癌中长链非编码RNA的鉴定及验证

摘要

目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)在肾透明细胞癌中的临床意义.方法:基于TCGA数据库中的肾透明细胞癌数据集分别鉴定异常表达的mRNA、miRNA和lncRNA,采用WGCNA确定与临床信息相关的关键lncRNA模块,根据ceRNA假说构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,在肾透明细胞癌的临床样本中验证了lncRNA在ceRNA网络中的临床意义.结果:包括109个lncRNA的蓝色模块与肾透明细胞癌的分期(cor=0.314,P<0.01)、转移(cor=0.224,P<0.01)和分级(cor=0.396,P<0.01)相关性最好,其中有15个lncRNA对肾透明细胞癌患者有较高的诊断价值.我们发现2个lncRNA、6个miRNA和39个mRNA在ceRNA网络中相互作用.生存分析表明,2个lncRNA(AL161937.2和LUC-AT1)是肾透明细胞癌患者的独立预后预测因子.对肾透明细胞癌的临床样本进行分析,AL161937.2和LUCAT1的高表达与肾透明细胞癌的晚期分期和高分级相关.结论:本研究通过lncRNA相关的ceRNA网络,为了解lncRNA在肾透明细胞癌中的作用提供了新的途径.LncRNA AL161937.2和LUCAT1可作为KIRC的诊断和预后标志物.