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葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因4种突变及蛋白结构分析

     

摘要

目的·研究葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase,G6PD)基因突变对酶蛋白结构及功能的影响,了解G6PD突变与酶学结构、功能的关系.方法·回顾性分析2014—2017年上海市儿童医院205103例新生儿G6PD缺乏症筛查记录,Wilcoxon检验分析酶活性与突变基因类型之间的关系.采用Psipred、SOPMA、JPred4预测蛋白的二级结构,SWISS-MODEL预测氨基酸链空间结构,Mupro、SDM、CUPSAT、mSCM、DUET、Dynamut预测蛋白突变前后稳定性变化,PROVEAN预测对蛋白功能的影响,PyMOL和LigPlot+修饰蛋白空间结构预测图.结果 ·230例样本酶活性检测阳性,对其中121例进行基因检测,共检出8种突变,除c.95A>G、c.1376G>T、c.1388G>A 3种常见突变,c.1024C>T也表现出高发生率.4种突变均导致蛋白结构改变,稳定性降低,对功能有不良影响;此外,c.1388G>A突变导致其远离甘油配体结合区.结论·4种突变均通过改变蛋白结构进而降低蛋白的稳定性,其中c.1388G>A突变还会影响蛋白与底物的结合能力.

著录项

  • 来源
    《上海交通大学学报(医学版)》|2020年第12期|1571-1578|共8页
  • 作者单位

    上海交通大学附属儿童医院 上海市儿童医院生物医学信息研究中心 上海 200040;

    上海交通大学附属儿童医院儿童精准医学大数据工程技术研究中心 上海 200040;

    上海交通大学附属儿童医院新生儿筛查中心 上海 200040;

    上海交通大学附属儿童医院 上海市儿童医院生物医学信息研究中心 上海 200040;

    上海交通大学生命科学技术学院 上海交通大学-耶鲁大学生物统计与数据科学联合中心 上海 200240;

    上海交通大学附属儿童医院 上海市儿童医院生物医学信息研究中心 上海 200040;

    上海交通大学附属儿童医院儿童精准医学大数据工程技术研究中心 上海 200040;

    上海交通大学生命科学技术学院 上海交通大学-耶鲁大学生物统计与数据科学联合中心 上海 200240;

    上海交通大学附属儿童医院新生儿筛查中心 上海 200040;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 新生儿疾病;
  • 关键词

    葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症; 基因突变; 酶活性; 酶蛋白结构; 蛋白稳定性;

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