O139, 142, 26混合血清型大肠杆菌的O-抗原基因簇的破译

摘要

应用鸟枪法扩增了一株从水肿病病死猪肠系膜淋巴结分离到的O混合血清型(O139, 142, 26)大肠杆菌的O-抗原基因,测序结果显示扩增的O-抗原基因长度为11 771 bp.通过生物信息学的方法对其结构进行分析,发现其具有10个开放阅读框架及功能基因种类.经与发表的大肠杆菌O139、O26和O142的O-抗原基因序列及O-抗原糖基链的结构进行比对,进化树分析,跨膜蛋白的结构分析以及对乳糖前体(Glc)添加乙酰基的机制分析,结果表明,该O混合血清型大肠杆菌的O-抗原基因与大肠杆菌O139的O-抗原基因进化关系最近.