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迭代函数系统模型在生物序列分析中的应用

         

摘要

介绍了关于完全基因组及蛋白质序列的测度表示.迭代函数系统(IFS)模型在分形理论中已有较长时间的研究.在此我们提出用IFS模型及递归的IFS(RIFS)模型来拟合完全基因组与蛋白质序列的测度表示.我们发现在拟合完全基因组的测度表示时,RIFS模型比IFS模型好,但在拟合蛋白质序列的测度表示时IFS模型比RIFS模型好.从IFS模型或RIFS模型中估计的参数可以用来讨论与生物分类进化及蛋白质结构预测有关的问题.

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