植物乳杆菌WCFS1和JDM1的糖代谢PPI网络鲁棒性研究

摘要

由于生长环境不同,植物乳酸杆菌WCFS1和JDM1的糖代谢存在差异.为研究两者糖代谢差异,本文利用复杂网络理论,构建植物乳酸杆菌WCFS1和JDM1糖代谢的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein—Protein Interaction,PPI)网络.通过研究两者糖代谢PPI网络的鲁棒性,发现在随机攻击、度攻击、介数攻击三种方式下,WCFS1的柠檬酸循环模块、戊糖磷酸途径模块的PP1网络的鲁棒性优于JDM1,较JDM1有较强的容错性.此外,发现WCFS1和JDM1的糖代谢PPI网络受介数高的节点影响较大.