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文冠果富集SSR文库的构建及特性分析

         

摘要

应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与文冠果基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体上,转入感受态细胞Trans5α,构建文冠果富集微卫星文库.利用M13F和M13R载体序列引物筛选文库,对插入片段长度为400~1 500 bp的克隆进行测序.共获得123条序列,55条(44.7%)含有微卫星位点,其中完美型占63.7%,非完美型22.4%,混合型10.3%.微卫星重复基元中,二核苷酸(AC)n最为常见.

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