西藏牦牛mtDNA ATP8全序列测定及遗传多样性分析

摘要

对西藏16个牦牛类群共367头个体的mtDNA ATP8(Adenosine Triphosphate 8)基因进行克隆及序列分析.结果表明,西藏牦牛mtDNA ATP8基因全长201 ～ 203 bp,T、C、A和G4种核苷酸的平均比例分别为29.3％、23.0％、41.8％和6.0％,A+T含量明显高于G+C,表现出一定的碱基偏倚性;在367头牦牛中,共检测到19个变异位点,其中单一信息位点15个,简约信息位点4个,存在转换和插入2种变异类型,碱基替换中存在转换73次,以A/G、T/C为主,占98.63％;在插入变异类型中以A碱基插入为主;367头牦牛共捡出20种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性指数分别为0.332和0.001 89,说明西藏牦牛具有较贫乏的遗传多样性;聚类分析显示,西藏牦牛可分为2类,其中桑日牦牛、类乌齐牦牛和桑日牦牛为1类,其余牦牛类群为另1类.20种单倍型可以分为2个聚类簇(Ⅰ和Ⅱ),其中聚类簇Ⅰ包含17种单倍型,占全部单倍型数的77.27％,包含了本次研究中的所有西藏牦牛类群;聚类簇Ⅱ中有3种单倍型,囊括了除错那、嘉黎、康布和帕里类群外的12个类群,显示西藏牦牛存在2个母系起源.