MGAT4A在肺腺癌组织中的表达及其临床意义

摘要

目的:探究α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶A(MGAT4A)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达情况,分析其在LUAD的发生、进展和预后的意义.方法:通过检索GEO等公共数据库,获得基因芯片数据集,选择样本数最大的GSE31210进行MGAT4A mRNA表达的计算;使用TCGA结合GTEx RNA测序数据集,进行第一轮验证;挑选基因芯片数据集中、样本数量排名第二的GSE40791,进行第二轮验证;收集3对广西医科大学第一附属医院的LUAD组织行RNA测序,进行第三轮验证;通过计算标准化均数差(SMD)及绘制综合受试者工作特征曲线(SROC),整合性分析了MGAT4AmRNA在上述4个LUAD数据集中的表达情况,进行第四轮验证.MGAT4A蛋白表达水平通过THPALUAD组织芯片使用免疫组化展示.通过绘制Kaplan-Meier生存曲线,研究MGAT4A在LUAD预后判断上的价值.通过对MGAT4A的相关基因进行功能富集分析,以探究其在LUAD发生发展中的潜在分子机制.结果:MGAT4AmRNA在4个数据集中均呈现出在LUAD组织中的低表达趋势(P＜0.05).整合858例LUAD组织分析,发现MGAT4AmRNA的SMD=-0.28,95％CI=0.42?-0.15.MGAT4A蛋白在LUAD中,亦有表达下降的趋势.MGAT4A的过表达,为LUAD预后的保护因素(P＜0.05).MGAT4A的负相关基因主要集中在"核糖体"、"新冠肺炎"、"过氧化物酶体"等通路上.结论:MGAT4A的表达下调或缺失,在LUAD的发生、进展及不良预后中发挥潜在的促进作用.