MAPK13基因表达在非小细胞肺癌临床预后中的作用

摘要

目的:使用生物信息学来确定与非小细胞肺癌(NSCLC)发展相关的潜在关键基因及其涉及的信号通路,探讨所得关键基因表达水平在NSCLC临床预后中的作用.方法:从GEO数据库中获取NSCLC基因芯片数据并使用R语言分析筛选差异表达基因;通过DAVID数据库进行差异基因的KEGG通路富集分析,通过STRING数据库及Cytoscape软件构建差异表达基因的蛋白—蛋白相互作用网络(PPI)并筛选关键基因.通过Kaplan Meier plotter在线数据库对NSCLC患者进行生存分析.结果:共筛选出61个差异表达基因;差异表达基因主要富集在癌症相关的信号通路;PPI网络分析表明,丝裂原活化蛋白激酶13(MAPK13)基因是重要的关键基因;Kaplan Meier plotter分析显示,MAPK 13基因表达水平与NSCLC患者预后明显相关,MAPK13基因表达水平越高生存率越高(HR =0.8,95％CI:0.70～0.91,P＜0.05).结论:MAPK13基因在NSCLC的发生发展中可能起着重要作用,是潜在的预后分子标志物.