绵羊脂肪型脂肪酸结合蛋白基因(A-FABP)的变异研究

摘要

[目的]明确绵羊A-FABP(adipocyte fatty-acid binding protein,A-FABP)基因的变异和单倍型特征.[方法]基于Ensemble数据库中绵羊A-FABP基因全序列,对7个绵羊品种共20个样本的A-FABP基因全序列进行测序分析.[结果]PCR扩增获得绵羊A-FABP基因全长6474 bp,A、T、G、C4种碱基的比例分别为31.48％、33.02％、17.21％和18.29％,A+T平均含量为64.50％,G+C平均含量为35.50％;共发现48处单碱基变异位点和2处微卫星位点M1 ((TG)n)和M2((TA)n),单一变异位点、2核苷酸变异位点和3核苷酸变异位点比例分别为28.85％、40.4％和0.02％;共发现转换、颠换、插入和缺失4种变异类型,其占变异位点总数的比例分别为45.83％、31.25％、2.08％及20.83％;共发现19种单倍型,单倍型多样度为0.995.[结论]A-FABP基因19个单倍型序列的NJ树分化为2个聚类簇,表明A-FABP基因单倍型最初由2个主要单倍型衍化形成.