视紫质样GPCR中偶联氨基酸的变构通讯网络

摘要

目的:预测视紫质样GPCR中由Leu-125等氨基酸组成的变构通讯网络.方法:基于视紫质蛋白的多序列比对,利用统计偶联分析方法计算该多序列比对中各氨基酸位点的统计能量.然后,提取该多序列比对在Leu-125氨基酸位点为异亮氨酸的序列组成子比对,根据子比对计算比对中任一位点和Leu-125氨基酸位点的统计偶联能量.结果:根据此统计偶联能量推测出与Leu-125偶联的氨基酸位点.结论:通过统计偶联分析推测出的与Leu-125偶联的氨基酸位点为研究证实了的视紫质样GPCR中的重要功能位点,它们构成了视紫质样GPCR的变构通讯网络.