31个SNP位点多重PCR扩增和芯片分型技术的建立及其法医学应用

摘要

目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究.方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片.采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在各SNP位点的基因型.将这一方法应用于109份样本的分型,根据基因型分布统计分析31个SNP位点的法医学应用价值.同时,进行家系调查和方法灵敏度分析.结果方法的灵敏度为1ng;所检测的31个SNP位点的累积个体识别率为0.9999999999979(偶合率为2.13×10-12),二联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9609,三联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.997 0.家系调查的结果表明,这些位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律.结论上述31个SNP位点为中高信息量位点,适用于法医学个体识别,可作为当前STR系统的补充.