花鲈cox6a基因与相关miRNA的鉴定及其在盐度适应中的表达调控分析

摘要

细胞色素c氧化酶（COX）是线粒体电子传递链的末端酶, COX6A是细胞色素c氧化酶的核编码亚基之一。为丰富花鲈（Latolabrax maculatus）细胞色素c氧化酶的基础研究,进一步了解cox6a基因及相关miRNAs在花鲈渗透调节机制中的潜在作用,本研究开展了花鲈cox6a基因的全基因组鉴定及序列分析、cox6a基因的组织表达谱分析和急性盐度转换后的表达分析。此外,预测了可能靶定花鲈cox6a基因的miRNAs,并对其与cox6a基因的功能相关性进行了分析。结果表明,花鲈具有2个cox6a基因（cox6a1、cox6a2）。系统进化树分析进一步确认了两个花鲈cox6a基因命名的准确性。多序列比对表明cox6a基因具有高度的保守性,尤其是C端。组织表达谱结果显示,花鲈cox6a1在垂体、脑、肝脏和肾脏中的表达量较高, cox6a2在心脏和肾脏中的表达量较高。共获得4个可能靶定cox6a2基因的miRNA:miR-30e-5p、miR-223、miR-200a-3p和miR-155-5p,但没有发现可能靶定cox6a1基因的miRNA。qRT-PCR的结果显示,在花鲈适应低盐和高盐环境的过程中,cox6a1、cox6a2基因以及miR-30e-5p、miR-223、miR-200a-3p都呈现显著差异表达,而miR-155-5p仅在适应高盐环境时出现了显著的差异表达。这表明,cox6a1、cox6a2基因和4个miRNAs在花鲈的渗透调节过程中发挥潜在作用。其中miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p的表达趋势与cox6a2呈负相关关系,以miR-223相关性最高。由此推测,miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p不同程度地参与了cox6a2基因的表达调控。本研究为探讨花鲈适应不同盐度环境的渗透调节机制提供了基础数据。