长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析

摘要

为探讨长江流域大眼鳜(Siniperca kneri)野生群体的遗传多样性和遗传结构,为长江大眼鳜野生群体资源的有效管理和合理开发利用提供基础科学数据支撑,本研究基于线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)基因及控制区(D-loop)全序列,对4个群体(赤水河群体-CS、南京群体-NJ、岳阳群体-YY、宜昌群体-YC)共计79尾个体进行了分析.结果如下:(1)获得了长1141 bp的Cyt b基因全序列,共检测到26种单倍型.单倍型多样性(haplotype diversity,Hd)指数为0.685(CS)～0.924(YC),核苷酸多样性(nucleotide diversity,π)指数为0.176％(CS)～0.285％(YY).群体内与群体间的遗传距离均在0.002～0.003.(2)获得了长度为834～840 bp的D-loop全序列,在79尾个体中共检测到46种单倍型.单倍型多样性指数为0.754(CS)～0.990(NJ),核苷酸多样性指数为0.548％(CS)～1.412％(YC).群体内遗传距离在0.005(CS)～0.014(YC),群体间遗传距离在0.008～0.012,提示4个野生群体均尚未达到亚种分化水平.分子方差分析(AMOVA)显示群体内的变异是总变异的主要来源,长江流域大眼鳜野生群体无显著遗传结构差异.