细胞色素b基因

摘要： 鲫(Carassius auratus)是中国分布范围最广的淡水鱼类之一,在越南也有自然分布。本文通过研究越南及中国广东阳春、潮州、广西博白和福建等地鲫样本的线粒体细胞色素b(Mitochondrial cytochrome b,Cyt b)基因遗传变异,以探讨越南和华南地区鲫的谱系地理格局。在146尾样本中,共检测出32种单倍型,分属于6个鲫线粒体谱系,总的单倍型多样性(0.900±0.016)和核苷酸多样性(0.017±0.008)均较高。分析结果显示:华南地区和越南共存在3个土著鲫的线粒体谱系(C1A、C1B和C1C),而不是之前认为的1个或2个。谱系C1A分布于福建,谱系C1B和C1C则分别分布于越南的北部和南部,两广地区可能是谱系C1A和C1B的重叠分布区。此外,这一区域还检测到了其他线粒体谱系,这种谱系混杂的格局可能与自然演化过程和人类活动有关。本研究加深了对鲫谱系地理格局的认识,有助于鲫种质资源的保护与利用。

摘要： 为了解东印度洋赤道、南海海域鸢乌贼(Sthenoteuthis oualaniensis)种群遗传结构,更好地对鸢乌贼渔业资源进行合理的管理,测定了东印度洋赤道北部和南部、南海北部和南部4个鸢乌贼群体共120尾个体线粒体DNA细胞色素b(cytochrome b)基因,分别对东印度洋赤道、南海海域鸢乌贼种群遗传结构展开研究。结果显示,4个群体总的核苷酸多样性与单倍型多样性为0.27332和0.981,其中南海北部海域群体的单倍型多样性最高为0.989,南海南部海域群体核苷酸多样性最高为0.30660。构建的单倍型网状图和系统发育树显示,东印度洋和南海群体间遗传分化显著。分子方差分析结果显示,遗传变异54.90%来自于组群间;群体间的F_(st)(F-statistics)分析表明,东印度洋赤道北部和南部群体F_(st)值为0.08588,南海北部和南部群体F_(st)值为0.02536,表明南海两个群体间不存在显著的遗传分化,东印度洋两个群体间遗传分化较小。东印度洋赤道两侧频繁的洋流活动可能是导致赤道南北群体遗传分化的重要因素,而东印度洋与南海之间的地理隔离则导致两个地理群体间遗传分化显著。综上所述,东印度洋赤道、南海海域鸢乌贼群体是两个独立的群体,在渔业管理上也应视为两个独立的管理单元。

摘要： 为了解云南鸽子血变原虫的感染情况,对采自玉溪地区的324只鸽子血样用套式PCR方法对线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)基因进行扩增,经测序比对分析,结果检出12份阳性样本,阳性率为3.70%;获得的序列与GenBank上公布的鸽血变原虫序列相似性达98%以上,运用MEGA6.0构建系统发育进化树,发现与鸽血变原虫虫株位于同一进化支。该调查结果为云南玉溪鸽子血变原虫的防控提供了数据支撑。

摘要： 从珠江水系中采集了7个群体共241尾光倒刺鲃样本,对其线粒体Cyt b序列进行了测定与分析.结果显示:序列长度1141 bp,共检测到37个核苷酸变异位点,9个单倍型,其中单倍型多样性为0.768±0.012,核苷酸多样性为0.0105±0.0052,其中北江水系群体具有中等遗传多样性,而其他水系群体遗传多样性较低.遗传距离和遗传分化指数显示,各群体间出现了一定遗传分化,其中东江水系与其他水系群体间遗传分化程度均较高.AMOVA分析表明,主要分子遗传变异(63.46％)来自于各地理分组之间.单倍型网络图和单倍型系统发育树显示,光倒刺鲃东江水系群体与部分北江水系群体具有较近的亲缘关系,而与西江亲缘关系较远.中性检验结果显示,全部光倒刺鲃以及各个群体在历史上均没有发生过明显的扩张.

摘要： 选取线粒体细胞色素b (cytochrome b,Cyt b)基因序列作为分子标记,分析了中国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)的种群遗传结构.2019年9-11月在中国沿海9个采样点共采集棘头梅童鱼342尾,共检测到174个单倍型.通过构建单倍型网络连接图和单倍型进化树发现,棘头梅童鱼可分为北方支系和南方支系.分子方差分析(AMOVA)结果显示,棘头梅童鱼的南北群体存在显著的遗传分化.核苷酸错配分布分析和中性检验结果显示,棘头梅童鱼在更新世经历过种群快速扩张,且估算北方群体和南方群体的种群扩张时间分别在0.799万～1.999万和2.631万～6.577万年前.根据净遗传距离推算出北方群体和南方群体的分化时间在34.5万～86.25万年前.综上得出,中国沿海棘头梅童鱼可分为南北两个种群,在渔业资源开发和管理上需要区别对待.

摘要： 绵羊是世界上最早被驯化的畜种之一,且在我国品种种类繁多,但如今由于长期进行杂交,导致畜种趋于减少、濒于消失甚至泯灭,其中我国特有的绵羊地方品种——兰州大尾羊便是其中一个濒临灭绝的畜种.本研究通过对甘肃地区的大尾羊绵羊品种的线粒体Cytb基因(Cytochrome?b?gene)进行扩增,并与国内外其他绵羊品种进行进化树分析,对其种群之间的系统发生关系进行了研究,结果表明:现存兰州大尾羊这一品种可能存在着较为严重的杂交情况,对探讨种群之间的系统发生关系及兰州大尾羊品种起源提供了理论依据,且对研究甘肃地区的绵羊品种起源以及对绵羊品种的保护和利用有着一定的意义.

摘要： 以线粒体cyt b基因为分子标记,对长江上游干流及汉江等9条支流13个地理种群的大鳞马口鱼Opsari-ichthys macrolepis Yang et Huang进行遗传多样性及种群历史动态分析,并探讨其谱系生物地理学过程.结果显示,414尾大鳞马口鱼样本中共检测到79个单倍型,整体的单倍型多样性(h=0.9301)和核苷酸多样性(π=0.129421)均较高.基于单倍型构建的最大似然树和贝叶斯树显示,所有单倍型分为2个谱系(A和B),谱系A分布于中游支流汉江、清江,谱系B分布于长江上游干支流及沅江,表现出东-西方向的空间差异.分子钟估算显示,2个谱系于早更新世(～1.34 Ma)分化.不同地理种群间的遗传分化指数为-0.01624～0.99827,除个别种群外,多数地理种群呈现高度分化,说明种群间存在显著的遗传隔离.空间分子方差分析显示,大鳞马口鱼种群具有一定的遗传结构,特别是老鹤河、任河、清江地理种群分化显著.贝叶斯天际线分析显示,大鳞马口鱼各地理种群的扩张和收缩时间为0.01～0.04 Ma,可能与冰期-间冰期旋回有一定关联.推测青藏高原的隆升以及更新世冰期的更迭对长江中上游大鳞马口鱼的遗传分化以及种群动态产生了重大影响.

摘要： 试验对新疆南部5个地区密点麻蜥线粒体DNA (Mitochondrial DNA,mtDNA)细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因序列进行PCR扩增和测序,采用邻接法和最大似然法分别构建系统进化树进行系统发育分析.结果 表明:南疆沙蜥独立于1个分支;所有麻蜥在1个分支上,与山地麻蜥(Eremias brenchleyi)的亲缘关系最远,与荒漠麻蜥(Eremias przewalskii)的亲缘关系最近;密点麻蜥种群间每个地区样本几乎均是独立分支,喀什地区的密点麻蜥与民丰的密点麻蜥亲缘关系最远,乌恰次之,与同市叶城和塔什库尔干的密点麻蜥亲缘关系最近,但喀什地区的M13稍有偏离,与乌恰的密点麻蜥属于同1个分支,表明这两地区的密点麻蜥存在基因交流.文章基于Cytb基因对新疆南部5个地区密点麻蜥进行系统发育分析,补充和丰富了新疆部分地区密点麻蜥的基础遗传数据.

摘要： 采用PCR和直接测序法分析中国五个家养雉鸡种群遗传结构.本试验获得了中国5个家养雉鸡种群线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列819bp,结果表明:中国环颈雉、蒙古雉鸡、黑化雉鸡、左家雉鸡、绿雉鸡碱基组成同源性较高,发现4个变异位点,其中823位置A-G互换,890位置A-G互换,1006位置T-C互换,628T-C颠换.定义了4个单倍型,分别为A1、A2、A3、A4.黑雉鸡与其余雉鸡种群的遗传距离较大.构建了5个家养雉鸡分子系统进化树,绿雉鸡单成一个系,中国环颈雉、蒙古雉鸡、黑化雉鸡,左家雉鸡可能存在基因交流.

摘要： 为了给保护利用和开发中国本土家驴遗传资源提供一些基础资料,并分析其遗传多样性和母系起源,我们首次详细调查了我国四个家驴品种种群线粒体的几乎完整的细胞色素b基因(cytb)序列.在本研究中,我们在分析的四个中国家驴品种群体中发现了丰富的线粒体DNA (mtDNA) 多样性和两个截然不同的线粒体母性世系,即索马里和努比亚世系.在研究的四个家驴品种中,发现了和以前研究结果相同的两种世系共存的模式.此外,研究的四个家驴品种中,地理区域、世系结构和母系起源之间也不存在明显的相互关系.研究的家驴Cytb基因的遗传变异格局表明这两个世系没有发生过群体扩张事件.

摘要： 本研究的目的是调查细胞色素b基因(Cytb)单倍型对中国三个家驴品种(德州驴、云南驴和凉州驴)生长性状的影响效应.对所有样本的Cytb基因型都通过单链构象多态(SSCP)进行了判定,并且与生长性状进行了关联分析.研究结果表明,多数情形下,该基因对生长性状的影响都不显著,并且,在三个品种家驴中其产生的效应也不相同.对云南驴来说,该基因对尻宽的影响比较显著(P＜0.05),并且,AA基因型的效应高于BB基因型的(1.6cm,约占该性状平均值的5.4％,P＜0.05).而对德州驴来说,该基因对体高的影响达到了显著水平(P＜0.05).本研究结果同时证明SSCP是由两个胞嘧啶转换成胸腺嘧啶和一个鸟嘌呤转换为腺嘌呤引起的,相应地引起了亮氨酸到脯氨酸和异亮氨酸到缬氨酸的氨基酸替换.

摘要： 为了研究海峡两岸淡水鱼类的种群遗传变异及其亲缘地理格局,采集了条纹小鲃在9个水系的14个地理种群共计151个样本,利用线粒体细胞色素b基因(cytb)全序列作为分子标记,分析了条纹小鲃种群的遗传多样性、遗传结构、分化时间、及种群历史动态.研究结果共检测到76个cytb单倍型。与其它一些分布在中国东南沿海地区的淡水鱼类物种相比，条纹小鲃有着相似的遗传多样性特征。种群分析的结果表明，条纹小鲃种群间具有高度的遗传分化，并且单倍型之间的系统发育关系与它们的地理分布具有相关性。通过分子变异空间分析，推测这两个地理区域组之间可能还存在着其它的地理隔离屏障，产生此隔离效应的地理障壁可能为南岭山系。

摘要： 根据绵羊线粒体DNA的序列设计引物，试用PCR扩增细胞色素b基因的一段序列，退火温度、Mg2+浓度对扩增体系没有影响，只有引物浓度对扩增产物有影响，说明引物的特异性和灵敏性较好，可初步用作绵羊的种属鉴别。

摘要： 长蛸(Octopus variabilis),隶属软体动物门,头足纲,八腕目,蛸科(Octopodidae),俗称长八带鱼、鲅须.在我国南北沿海海域均有分布,其中北部海域较多.本研究通过测定4个不同地理群体90尾长蛸的细胞色素b基因，分析其234 bp的同源片段。经过比较共检测到22个单倍型，除了单倍型1和3为大连和青岛共有，其余单倍型均为4个地理群体所特有。通过对序列进行分析，可以得到：单倍型多样性指数(H)达0.854+0.015，核苷酸多样性指数(P)达0.05855±0.00547，平均核苷酸多样性指数K达13.526，具有一定的遗传多样性。本研究结果对长蛸资源的合理开发和利用具有重要启示。结果表明，我国长蛸的遗传多样性较高，而且群体间存在较大的遗传分化，特别是大连和青岛群体所处的黄海、渤海群体和温州、福建群体所处的东海和南海群体之间分化尤其明显，因此在今后的开发管理中需要区别对待，使长蛸资源发挥最大的经济价值。

摘要： 以线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因的全序列作为遗传标记,探讨花斑鳅3亚种(指名亚种Cobitis melanoleucamelanoleuca、北方鳅亚种c砚gr03zoei和格氏鳅亚种c m.gladkovi)的分类地位.基于Kimura双参数法计算河北花斑鳅指名亚种个体间的遗传距离为0.2％～1.1％,俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种之间的平均遗传距离为0.1％～1.5％,而河北花斑鳅指名亚种与俄罗斯花斑鳅3个亚种之间的平均遗传距离为1.7％～2.6％.分子系统树显示,花斑鳅分为两大分支:分支I为河北花斑鳅指名亚种8个单倍型类群,分支Ⅱ含俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种以及辽宁北方鳅亚种.结合已有研究结果得出:花斑鳅指名亚种仅分布于中国,而俄罗斯也仅有北方鳅亚种1个物种,两者的分化时间约为2.50～3.09百万年.

摘要： 以线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因的全序列作为遗传标记,探讨花斑鳅3亚种(指名亚种Cobitis melanoleucamelanoleuca、北方鳅亚种c砚gr03zoei和格氏鳅亚种c m.gladkovi)的分类地位.基于Kimura双参数法计算河北花斑鳅指名亚种个体间的遗传距离为0.2％～1.1％,俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种之间的平均遗传距离为0.1％～1.5％,而河北花斑鳅指名亚种与俄罗斯花斑鳅3个亚种之间的平均遗传距离为1.7％～2.6％.分子系统树显示,花斑鳅分为两大分支:分支I为河北花斑鳅指名亚种8个单倍型类群,分支Ⅱ含俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种以及辽宁北方鳅亚种.结合已有研究结果得出:花斑鳅指名亚种仅分布于中国,而俄罗斯也仅有北方鳅亚种1个物种,两者的分化时间约为2.50～3.09百万年.

摘要： 以线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因的全序列作为遗传标记,探讨花斑鳅3亚种(指名亚种Cobitis melanoleucamelanoleuca、北方鳅亚种c砚gr03zoei和格氏鳅亚种c m.gladkovi)的分类地位.基于Kimura双参数法计算河北花斑鳅指名亚种个体间的遗传距离为0.2％～1.1％,俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种之间的平均遗传距离为0.1％～1.5％,而河北花斑鳅指名亚种与俄罗斯花斑鳅3个亚种之间的平均遗传距离为1.7％～2.6％.分子系统树显示,花斑鳅分为两大分支:分支I为河北花斑鳅指名亚种8个单倍型类群,分支Ⅱ含俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种以及辽宁北方鳅亚种.结合已有研究结果得出:花斑鳅指名亚种仅分布于中国,而俄罗斯也仅有北方鳅亚种1个物种,两者的分化时间约为2.50～3.09百万年.

摘要： 以线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因的全序列作为遗传标记,探讨花斑鳅3亚种(指名亚种Cobitis melanoleucamelanoleuca、北方鳅亚种c砚gr03zoei和格氏鳅亚种c m.gladkovi)的分类地位.基于Kimura双参数法计算河北花斑鳅指名亚种个体间的遗传距离为0.2％～1.1％,俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种之间的平均遗传距离为0.1％～1.5％,而河北花斑鳅指名亚种与俄罗斯花斑鳅3个亚种之间的平均遗传距离为1.7％～2.6％.分子系统树显示,花斑鳅分为两大分支:分支I为河北花斑鳅指名亚种8个单倍型类群,分支Ⅱ含俄罗斯花斑鳅指名亚种、北方鳅亚种和格氏鳅亚种以及辽宁北方鳅亚种.结合已有研究结果得出:花斑鳅指名亚种仅分布于中国,而俄罗斯也仅有北方鳅亚种1个物种,两者的分化时间约为2.50～3.09百万年.

摘要： 本发明涉及用于确定细胞色素P450 1A2(CYP1A2)、2A6(CYP2A6)和2D6(CYP2D6)、PXR和UDP-葡萄糖醛酸基转移酶1A(UGT1A)基因的基因型的单倍型标签单核苷酸多态性(htSNP)和使用所述htSNP的基因芯片，更具体而言，涉及用于确定人类CYP1A2、CYP2A6、CYP2D6、PXR和UGT1A基因的单倍型的htSNP的选择方法、使用所述htSNP确定所述基因的基因型的方法和用于所述方法的基因芯片。

摘要： 本发明涉及细胞色素P450、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸‑细胞色素P450还原酶及其应用。本发明揭示了一组新的、在萜类化合物羟基化催化及灵芝三萜合成中发挥作用的细胞色素P450(P450 GP01和P450 GP02)，以及与之配合完成羟基化催化的一种烟酰胺腺嘌呤二核苷酸‑细胞色素P450还原酶(GLCPR)。更具体地，本发明的细胞色素P450 GP01能特异和高效地催化四环三萜化合物底物的C‑23位的羟基化；本发明的细胞色素P450 GP02羟基化灵芝酸DM和灵芝酸TR生成多种产物；本发明的GLCPR能够与细胞色素P450配对，协助细胞色素P450发挥羟基化活性。

摘要： 本发明涉及基因工程技术领域，具体地说涉及食蟹猴细胞色素P450 3A5基因和食蟹猴NADPH-细胞色素P450氧化还原酶基因、分别含有该两个基因的的重组载体、用载体转化的宿主、以及转化体产生的重组病毒。包括生产具有酶活性的基因表达产物及它们在药物筛选中的应用。

摘要： 本发明公开了丹参中一条反向调控丹参酮合成的细胞色素P450基因CYP72A395的编码基因序列；本发明所提供的CYP72A395基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述基因编码蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。本发明检测了CYP72A395的转录表达谱，发现其在丹参花和根周皮高丰度表达；构建了CYP72A395‑RNAi载体及CYP72A395‑过表达(CYP72A395‑oe)载体，通过发根农杆菌介导的丹参遗传转化获得转基因毛状根阳性株系；化学检测分析发现，在CYP72A395‑RNAi株系中，丹参酮类化合物含量升高，而在CYP72A395‑oe株系中，丹参酮类化合物含量显著降低。本发明提供的CYP72A395具有负调控丹参酮类化合物生物合成的功能，可能参与丹参酮生物合成途径的竞争途径。本研究为提高丹参中丹参酮产量提供了新思路，并为丹参酮合成生物学研究奠定基础。

摘要： 本发明涉及用于确定细胞色素P450 1A2(CYP1A2)、2A6(CYP2A6)和2D6(CYP2D6)、PXR和UDP－葡萄糖醛酸基转移酶1A(UGT1A)基因的基因型的单倍型标签单核苷酸多态性(htSNP)和使用所述htSNP的基因芯片，更具体而言，涉及用于确定人类CYP1A2、CYP2A6、CYP2D6、PXR和UGT1A基因的单倍型的htSNP的选择方法、使用所述htSNP确定所述基因的基因型的方法和用于所述方法的基因芯片。

摘要： 本发明涉及细胞色素P450、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸‑细胞色素P450还原酶及其应用。本发明揭示了一组新的、在萜类化合物羟基化催化及灵芝三萜合成中发挥作用的细胞色素P450(P450 GP01和P450 GP02)，以及与之配合完成羟基化催化的一种烟酰胺腺嘌呤二核苷酸‑细胞色素P450还原酶(GLCPR)。更具体地，本发明的细胞色素P450 GP01能特异和高效地催化四环三萜化合物底物的C‑23位的羟基化；本发明的细胞色素P450 GP02羟基化灵芝酸DM和灵芝酸TR生成多种产物；本发明的GLCPR能够与细胞色素P450配对，协助细胞色素P450发挥羟基化活性。

摘要： 提供了细胞色素P450多肽，包括细胞色素P450檀香烯氧化酶多肽、细胞色素P450香柠檬烯氧化酶多肽和细胞色素P450还原酶多肽。还提供了编码所述细胞色素P450多肽的核酸分子。提供了包含所述核酸和/或所述多肽的细胞，以及通过培养所述细胞来产生萜(例如檀香醇和香柠檬醇)的方法。

摘要： 本发明属于基因工程领域，具体涉及一种人细胞色素P450 3A5酶及NADPH-细胞色素P450氧化还原酶共表达体系，其包括宿主酵母，以及定向插入P450氧化还原酶基因和人源P450 3A5基因的双表达载体。本发明所构建的人细胞色素P450 3A5酶及NADPH-细胞色素P450氧化还原酶共表达体系可在酵母中异源表达，此外，还可解决酵母细胞P450氧化还原酶表达水平较低的缺陷，能够保证被转染的细胞同时表达两种蛋白，可大量制备代谢物。

摘要： 本发明公开了编码双峰驼细胞色素P450的核苷酸序列、双峰驼细胞色素P450及其应用，涉及基因工程技术领域。本发明的主要技术方案为：一种编码双峰驼细胞色素P450的核苷酸序列，所述核苷酸序列是序列表中SEQ ID NO:1第29-1580位。或者，所述核苷酸序列在高严谨条件下与SEQ ID NO:1第29-1580位的核苷酸序列杂交且编码双峰驼细胞色素P450。或者，所述核苷酸序列与SEQ ID NO:1第29-1580位所述的核苷酸序列具有90％以上同源性且编码双峰驼细胞色素P450。一种双峰驼细胞色素P450，由如上所述核苷酸序列编码。

摘要： 本发明涉及基因工程技术领域，具体地说涉及食蟹猴细胞色素P450 3A5基因和食蟹猴NADPH－细胞色素P450氧化还原酶基因、分别含有该两个基因的的重组载体、用载体转化的宿主、以及转化体产生的重组病毒。包括生产具有酶活性的基因表达产物及它们在药物筛选中的应用。