校正肿瘤纯度影响的差异表达基因分析

摘要

针对肿瘤组织中正常细胞的混入对差异表达产生不利影响的问题,构建了肿瘤样本基因表达的混合概率模型,通过广义最小二乘模型和Wald检验来确定每个基因在肿瘤和正常细胞之间的差异性.通过对TCGA肿瘤数据的分析表明,无论是在预测敏感性、肿瘤间统计量一致性指标上还是在对应癌症类型功能关联性上,所提方法都优于常用的limma.