轮状病毒腹泻患儿NSP4基因变异与临床关系

摘要

目的研究腹泻患儿的轮状病毒( RV)流行株非结构蛋白 4( NSP4)的基因变异与临床的关系.方 法对昆明地区 2002年和 2003年流行期不同程度腹泻患儿中分离出的 22株轮状病毒流行株的 NSP4基因进行 RT-PCR扩增,并进行 cDNA序列分析,与来自 GenBank Database的 4株人 RV( Wa、 KUN、 AU-1、 Hochi)和 3株动物 RV( EW、 OSU、 SAll)以及我国不同地区 RV流行株 NSP4的基因变异情况进行比较.结果氨基酸同源性表明昆明地区轮状病毒流行株间的同源性高达 98.9%～ 99.4%, 22株流行株全都属于 Wa组.氨基酸进化树提示在 Wa组内又包括 3个亚组.NSP4基因变异与轮状病毒腹泻临床症状严重程度不相关( P>0.05).结论 2002年和 2003年昆明地区轮状病毒流行株皆属 Wa组,且其氨基酸序列极为保守; NSP4基因变异与轮状病毒腹泻临床症状严重程度不相关,但与流行发病的关系需继续研究.