基于TCGA数据库筛选与胃癌预后相关的差异基因

摘要

cqvip:目的通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因。方法从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基因后,对差异基因进行生存分析。结果共得到175个差异表达miRNA及201个差异表达mRNA/lncRNA,进一部进行生存分析,以P<0.05作为统计筛选标准,得到15个miRNA和9个mRNA、8个lncRNA与胃癌的生存时间相关。结论通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据进行分析研究,选出与该病预后密切相关的基因,为该病的早期诊断和靶向治疗提供分子层面的参考信息。