非小细胞肺癌循环肿瘤DNA突变特征与放疗敏感相关性研究

摘要

目的:通过高通量测序技术检测非小细胞肺癌患者外周血循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)的突变特征,并分析其与肿瘤等效退缩率之间的相关性,探讨ctDNA对放射治疗敏感性的评估价值.方法:纳入四川省肿瘤医院初治的非小细胞肺癌患者35例,采集静脉血分离血浆ctDNA,进行Illumina HiSeq PE150测序,获取突变特征谱;按肿瘤等效退缩率将入组患者分为敏感组和抵抗组.采用t检验或秩和检验进行统计学分析.结果:非小细胞肺癌ctDNA突变特征主要表现为单核苷酸突变,其中以外显子编码区域错义突变为主,另有部分同义突变,非编码RNA突变及非翻译区突变等,但它们的发生率在敏感组和抵抗组之间差异均无统计学意义(P>0.05);基因拷贝数变异是非小细胞肺癌ctDNA突变的另一主要表现,它包括有变异类型的重复和缺失,变异数目的多少及区域的大小,其中变异类型及数目在敏感组和抵抗组之间差异无统计学意义(P>0.05),但基因拷贝数变异区域的大小,在敏感组和抵抗组之间差异具有统计学意义(P=0.014),秩相关分析显示相关系数rs=0.554,进一步分析其变异重复类型区域的大小,在敏感组和抵抗组之间差异也具有统计学意义(P=0.008),秩相关系数rs=0.591.结论:非小细胞肺癌ctDNA突变中非同义突变、非翻译区突变、非编码RNA突变均与放射敏感无相关性,基因拷贝数变异类型及数目均与放射敏感性无关,但变异区域的大小,尤其是重复区域的大小与肿瘤放射敏感呈现出负相关性.