湖北后河国家级自然保护区短萼黄连的分子鉴定与分析

摘要

使用DNA条形码分子鉴定技术,对湖北后河国家级自然保护区野生黄连物种进行分子鉴定,为保护区黄连的种质资源保护及潜在开发利用提供前期工作基础.共收集湖北后河、四川峨眉等不同产地的黄连植株及其近缘物种12份,对其进行DNA提取,PCR扩增和测序;对实验样本和GenBank下载的序列进行多序列比对、BLAST分析和NJ系统发育树构建.共获得黄连及其近缘物种ITS2序列82条、psbA-TrnH序列24条.不同种属黄连分别聚类.其中,黄连、短萼黄连种内平均K2P遗传距离分别为0.017和0.008,黄连属间为0.051.结合形态学鉴定和中药材DNA条形码技术,不同种属的黄连可以很好地区分.成功鉴定湖北后河国家级自然保护区野生黄连物种为短萼黄连(Coptischinensis var.brevisepala),其ITS2、psbA-TrnH序列长度分别为200 bp和258 bp.