鲈形目线粒体DNA蛋白编码基因的适用性分析

摘要

[目的] 对线粒体DNA 13种蛋白质编码基因的系统进化分析能力进行了评估.[方法] 单个基因和基因拼接序列比较,综合考虑序列的信息量和邻位连接法构建系统进化树的置信度.[结果] 按分类阶元不同将基因都分成不同的4等.在鲈形目的科间阶元,最好的为ND6和cox2;好的序列为ND5和ND4;ND4L、ND3和ATP8差;包括Cyt b、cox1在内的其余6种基因为中等;在属内种间阶元,最好的为ATP6和cox2;好的序列为ND2和cox1;ND6、ND3和ATP8差;包括Cyt b在内的其余6种基因为中等.另外,分析揭示序列长度的增加可以提高系统进化树的置信度,且属内物种间比较时序列长度的影响小于高级阶元.[结论] 线粒体DNA蛋白质编码基因的信息分布具不均一性,需分类阶元选择最佳基因和组合.