我国部分区域链格孢属 rDNA ITS区序列分析

摘要

[目的]对我国部分区域链格孢属rDNA ITS序列进行分析,从而在分子水平上对其进行鉴定.[方法]使用通用引物ITS4和ITS5对分离自我国部分区域不同寄主链格孢属(Alternaria Nees)34个菌株进行ITS基因(ITS1-5.8S-ITS2)的PCR扩增和测序.[结果]序列分析结果表明:5.8S rDNA 全长为159 bp,保守程度高,参试的34株菌均一致;ITS 区变化相对较大.与A.tenuissima或A.alternata100%同源的分离菌株均表现出对地域和基质的广适性;菌株在5.8S/ITS存在的差异,说明寄主本犀科的丁香叶、蔷薇科、茄科等部分植物的链格孢具有一定的多样性. 但同时也发现ITS序列标记在链格孢属部分种间应用有一定的局限性;基于序列ITS1-5.8S-ITS2 聚类关系与其地理来源和寄主相关性不大.[结论]ITS序列分析法可为链格孢属的分子鉴定提供理论依据.