基于Cytb基因全序列4个鸡品种遗传多态性和起源

摘要

动物线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cytb)基因是重要的功能蛋白编码基因,其进化速率中等,一个较小的片断就包含了丰富的遗传进化信息,被认为是研究动物从种内到种间乃至科间的遗传多态性和系统进化的理想分子标记.为探明我国江西省部分地方鸡(Gallus domesticus)品种线粒体Cytb基因遗传多态性特点,本研究以江西省4个地方鸡品种为研究对象,利用DNA测序技术测定Cytb基因全长序列,进行遗传多态性分析.结果表明,4个品种Cytb序列全长均为1143 bp,共有12个突变位点和9种单倍型,其中单倍型Hap4为4个品种共有.4个品种平均核苷酸差异(average number of nucleotide differences,K)为1.971,平均单倍型多样度(haplotype diversity,Hd)为0.724,平均核苷酸多样度(nucleotide diversity,Pi)为0.00172;安义瓦灰鸡K和Pi均最大,分别为3.105和0.00272;白耳黄鸡Hd最大,为0.752;丝羽乌骨鸡的K值、Pi值和Hd值均最低.4个鸡品种在形成过程中系统发育关系和起源分析显示,丝羽乌骨鸡可能起源于原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus);东乡绿壳蛋鸡、安义瓦灰鸡和白耳黄鸡可能起源于原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)和原鸡印度亚种(Gallus gallus murghi).本研究结果为鸡品种遗传资源保护和开发利用提供了理论依据.