本氏烟草KANADI基因的克隆及表达分析

摘要

KAN基因参与控制拟南芥侧生器官的发育.为深入研究KAN基因控制植物器官发育的分子机制,本研究采用RT-PCR方法克隆了本氏烟草(Nicotiana benthamiana)KANADI基因家族的全部成员,并对其器官表达谱进行了分析.结果显示,本氏烟草中KANADI基因家族具有8个同源基因,(Genbank登录号分别为:NbS00016721g0007.1、NbS00015047g0006.1、NbS00014907g0003.1、NbS00043258g0009.1、NbS00006363g0003.1、NbS00042927g0003.1、NbS00019379g0012.1和NbS00006074g0004.1),每个成员与茄科基因库中对应的同源基因的蛋白序列的相似性均在70％～93％之间,并且具有KANADI家族蛋白特有的保守区和GARP结构域;对该基因家族编码的蛋白结构的生物信息学分析结果显示,该基因家族都编码亲水性的非分泌蛋白,没有明显的跨膜区;实时荧光定量PCR检测显示,该家族基因在本氏烟草各器官中均有表达,但具有不同的表达模式.本研究为进一步深入研究KANADI基因的功能及与其他基因家族之间的相互关系提供了重要依据.