BmNPV半胱氨酸蛋白酶基因的核苷酸序列研究

摘要

对家蚕核型多角体病毒苏州株（BmNPVsu)光胱氨酸蛋白酶基因（CP）的序列分析表明，该基因读码框为972个核苷酸，编码323个氨基酸。同源性分析表明，BmNPVsu的CP与芷蓿银纹夜蛾核型多角体病毒（AcNPV)、美国白蛾核型多角体病毒（HcNPV)、云杉卷叶蛾核型多角体病毒（CfNPV)、黄杉毒蛾核型多角体病毒（OpNPV)、舞毒蛾核型多角体病毒（Ld-NPV)在DNA水平上的同源性分别为96.5%、76．2％、74．9％、72．7％、62．9％；在氨基酸水平上的同源性分别为96．9％、77．1％、79．3％、77．1％、65．6％。BmNPV CP的氨基酸序列与不同来源的木瓜蛋白酶超家族的CP也具有较高的同源性，特别与Trpanosoma brucei的CP具有较高的一致性，达32％。在组织蛋白酶B、H、L、S以及木瓜蛋白酶的36个保守氨基酸残基中有31种出现在BmNPVsu的CP中，BmNPVsu CP同其它杆状病毒CP一样，可看作木瓜蛋白酶超家族成员。