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干旱胁迫下野生大豆bHLH家族转录组分析

         

摘要

为获取干旱胁迫状态下的bHLH家族相关基因,以30 d苗龄的野生大豆为试验材料,浇灌20%PEG-6000模拟干旱胁迫,分别在干旱处理后0、6、12、24、48 h取样提取叶片RNA并进行转录组测序.以基因本体论数据库(GO)、京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)、NCRI蛋白数据库(NR)注释的结果为基础,以bHLH转录因子为关键词进行筛选,再综合转录因子分析中提供的相关数据,共获得177条相关序列,包括64个bHLH家族成员.通过蛋白网络互作分析确定了4个干旱相关基因.为进一步研究野生大豆干旱胁迫下bHLH家族抗旱基因提供了理论基础.

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