银杏bHLH家族转录因子生物信息学及表达分析

摘要

bHLH是广泛存在于真核生物中的一个转录因子超家族,在生物的多种生命过程中起着十分重要的作用.银杏作为一种重要的经济树种,其基因组信息已经得到解锁.本研究以银杏基因组数据为基础,通过生物信息学手段,从银杏的41840条序列中共计鉴定出72个bHLH家族成员,并对其理化性质、保守结构域、基因结构和系统进化等方面进行了分析.结果 表明,银杏不同bHLH转录因子蛋白序列长度和分子量差异较大,同时理论等电点和脂肪族氨基酸指数以及亲水性比较接近;银杏bHLH转录因子均含有该家族蛋白特有的N端碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区;银杏bHLH转录因子可分为17个亚家族,同一个亚家族的成员保守基序的类型十分相似;表达分析发现,有7条银杏bHLH基因的表达具有组织特异性,有6条基因在各组织中表达都比较高,预测其在银杏生物过程中起到十分重要的作用.本研究为银杏bHLH转录因子家族的功能研究提供了一定的理论基础.