高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡 GH 基因多态性及生物信息学分析

摘要

以高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为研究对象，构建品种DNA池，PCR扩增生长激素（GH）基因所有外显子和部分内含子序列，采用直接测序法对3个鸡种的 GH 基因进行多态性检测，利用生物信息学软件预测不同多态性位点对GH 基因 mRNA 二级结构的影响，旨在通过对贵州胫长差异较大的高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡 GH 基因的多态性及其生物信息学进行分析，研究 GH 基因对不同鸡种胫骨发育的影响。结果表明：在高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡3个鸡种GH 基因中共检测到8个 SNPs 位点，其中 A1133G、G1166A 位于第2内含子区，C2027G、C2030T 位于第4外显子区， G2152A 位于第4内含子区，G3347A 位于第5外显子区，T3416C 和 C3436T 位于3′非编码区。生物信息学分析显示位于外显子区的3个 SNPs 均为同义突变，对 GH 基因的 mRNA 二级结构有一定影响。