凡纳滨对虾钙网蛋白cDNA序列的克隆及组织表达分析

摘要

利用RACE技术,克隆了凡纳滨对虾钙网蛋白(calreticulin,CRT)基因(GenBank登录号:JQ682618).该基因(LvCRT) cDNA全长1 866 bp,含有1个长达1 221 bp的完整开放阅读框(ORF),编码的成熟肽由406个氨基酸组成,5'UTR(5’非编码区)长度为222 bp,3'UTR长度为423 bp,3’端加尾信号AATAAA位于poly (A)尾巴上游27 bp处.预测其理论分子量是15.3 ku,等电点pI为4.90.具有1个保守的钙网蛋白家族标签(KHEQNIDCGGGYLKVF),1个信号肽(MKTWVFLALFGVVLVES)和保守的HDEL内质网回收标签.经NCBI BLASTX比对表明,LvCRT基因与中国明对虾和斑节对虾的LvCRT具有高度的相似性和一致性.系统进化分析表明,LvCRT在亲缘关系上更接近昆虫的钙网蛋白基因.荧光定量PCR结果显示CRT在肌肉组织中表达量最低,在肠中的表达量最高.对凡纳滨对虾CRT基因全长cDNA序列克隆和表达的研究为更进一步了解CRT多肽在凡纳滨对虾中的重要功能奠定了基础.